组织部是在校团委书记班子领导下，负责全校共青团组织、干部和团员队伍建设的重要职能部门。主要工作包括：研究制定并领导执行全校共青团组织、干部和团员队伍建设的政策、措施；指导所属各级基层团组织的组织、干部队伍和团员队伍建设；负责校团委机构编制、干部人事等项工作。具体工作包括：全校团员发展、团籍注册、团费收缴和年统工作；十月评优（市、校两级先进集体、优秀学生、优秀学生干部评选）、五月评优（校优秀共青团员,优秀团干部,优秀团支部）、年终评优（校五四红旗团组织、优秀团组织鼓励奖、二级团组织特别奖、附属医院团工作特色品牌、优秀分团委书记、附属医院团工作先进个人等）、市五四红旗团组织等相关评选等市级、校级各类评优工作；规划、指导、监督“基层团支部成长计划”的实施；校团委及分团委主要团干部的选拔、任免、考核、奖惩工作和校团委各部门考评工作等。组织部的指导原则是高度的原则性和高度的灵活性的统一，既要按照团内、校内的各项工作规定、要求严格执行，又要充分考虑我校各级团组织的实际情况，因时因地因人的制定各项工作制度和考评标准，一切以符合共青团服务育人理念和有利于全校广大青年和共青团员为出发点和落脚点。现下设团务科、基建科、人事科、内建科四个科室，分别负团员管理及校级、市级评优工作，基层团组织建设与管理工作，团干部的选拔、任免、考评工作，组织部内部建设规划工作。